Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 CD86-203ENST00000393627 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC113404.3-201ENST00000506621 555 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
COG3Q96JB2 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms