Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
VPS72Q15906 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.6 ms