Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL139135.2-201ENST00000445040 433 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 KDM5DP1-201ENST00000622542 298 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MS4A7-211ENST00000534016 1378 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MBNL1-217ENST00000485509 1023 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
VAMP3Q15836 MIR6762-201ENST00000613340 86 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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