Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC005034.4-201ENST00000603612 899 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TAF1AQ15573 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms