Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ALCAMQ13740 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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