Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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CUL3Q13618 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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CUL3Q13618 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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CUL3Q13618 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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CUL3Q13618 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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CUL3Q13618 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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CUL3Q13618 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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CUL3Q13618 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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CUL3Q13618 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CUL3Q13618 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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CUL3Q13618 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CUL3Q13618 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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