Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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TCIRG1Q13488 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
TCIRG1Q13488 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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