Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
AP3B2Q13367 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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