Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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TRAF1Q13077 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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TRAF1Q13077 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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TRAF1Q13077 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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TRAF1Q13077 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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TRAF1Q13077 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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TRAF1Q13077 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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TRAF1Q13077 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
TRAF1Q13077 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
TRAF1Q13077 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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