Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
HOXD10P28358 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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HOXD10P28358 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
HOXD10P28358 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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