Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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PTPRBP23467 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AL031963.1-201ENST00000447644 695 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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