Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 AC005520.3-201ENST00000602874 370 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
GDAP2Q9NXN4 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
GDAP2Q9NXN4 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms