Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 AC005070.2-201ENST00000604391 260 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AP001554.1-201ENST00000604533 376 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AL590396.3-201ENST00000636334 300 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA0391-203ENST00000534898 2611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF415-204ENST00000594011 2630 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 STN1-202ENST00000369764 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AP003471.1-202ENST00000319051 1988 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC069222.1-201ENST00000608028 3360 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC020978.6-201ENST00000571197 3177 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC016722.1-201ENST00000453936 652 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 HNRNPA1P71-201ENST00000559135 950 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC138749.2-201ENST00000566048 167 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 COX6CP16-201ENST00000603667 216 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC243725.1-201ENST00000637164 436 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01013-201ENST00000422700 1831 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 DTNA-205ENST00000399113 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TIMMDC1Q9NPL8 THSD7B-202ENST00000409968 6111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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