Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCSER1Q9C0I3 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCSER1Q9C0I3 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCSER1Q9C0I3 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCSER1Q9C0I3 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCSER1Q9C0I3 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCSER1Q9C0I3 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCSER1Q9C0I3 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCSER1Q9C0I3 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCSER1Q9C0I3 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCSER1Q9C0I3 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCSER1Q9C0I3 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCSER1Q9C0I3 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCSER1Q9C0I3 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CCSER1Q9C0I3 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCSER1Q9C0I3 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CCSER1Q9C0I3 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RPL26P29-201ENST00000415623 438 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCSER1Q9C0I3 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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