Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLIP4Q8N3C7 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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