Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 NACAP6-201ENST00000509572 622 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 EGFLAM-211ENST00000514476 676 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 MIR6885-201ENST00000612241 66 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 DEPDC1B-201ENST00000265036 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 MTERF4-205ENST00000407095 799 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC01789-202ENST00000455614 491 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 NXPE2P1-201ENST00000543705 726 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 POLR2B-202ENST00000381227 4108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
CSPP1Q1MSJ5 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms