Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC105460.2-202ENST00000502936 825 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SIX1Q15475 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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