Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 IQCM-205ENST00000636414 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
NFIXQ14938 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms