Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SRSF5Q13243 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms