Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
CHAF1AQ13111 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
CHAF1AQ13111 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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