Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC011287.1-204ENST00000640300 1213 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
EPHB4P54760 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
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