Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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