Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRBP23467 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRBP23467 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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