Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
PTPRAP18433 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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PTPRAP18433 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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PTPRAP18433 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
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PTPRAP18433 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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PTPRAP18433 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
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PTPRAP18433 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
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PTPRAP18433 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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PTPRAP18433 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
PTPRAP18433 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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