Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
VAX2Q9UIW0 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAX2Q9UIW0 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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