Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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USP35Q9P2H5 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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USP35Q9P2H5 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
USP35Q9P2H5 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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