Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 CFHR3-203ENST00000391985 1043 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms