Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC9Q96Q05 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TRAPPC9Q96Q05 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms