Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RPL7P16-201ENST00000479738 738 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
GTF3C6Q969F1 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms