Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 DPRXP4-201ENST00000578053 568 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SGCBQ16585 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
SGCBQ16585 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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