Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AL359757.1-201ENST00000623176 255 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 RMST-202ENST00000541282 2099 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC022336.1-201ENST00000475510 337 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
CHRNA6Q15825 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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