Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
RAB39AQ14964 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms