Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 PLCZ1-201ENST00000266505 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM28Q13263 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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