Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
CHAF1BQ13112 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
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