Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
GRIK2Q13002 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GRIK2Q13002 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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