Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
TTPAP49638 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC010245.1-201ENST00000511329 754 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
TTPAP49638 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
TTPAP49638 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms