Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
CASQ1P31415 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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CASQ1P31415 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CASQ1P31415 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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