Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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VPS72Q15906 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
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VPS72Q15906 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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VPS72Q15906 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
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VPS72Q15906 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
VPS72Q15906 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
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