Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MIR6806-201ENST00000622141 64 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SEC23BQ15437 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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SEC23BQ15437 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SEC23BQ15437 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SEC23BQ15437 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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SEC23BQ15437 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SEC23BQ15437 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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SEC23BQ15437 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SEC23BQ15437 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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