Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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SYCP1Q15431 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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