Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
ITGB3BPQ13352 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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ITGB3BPQ13352 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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ITGB3BPQ13352 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
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ITGB3BPQ13352 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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ITGB3BPQ13352 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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ITGB3BPQ13352 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
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ITGB3BPQ13352 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
ITGB3BPQ13352 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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