Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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