Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CENPFP49454 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CENPFP49454 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CENPFP49454 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CENPFP49454 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CENPFP49454 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CENPFP49454 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CENPFP49454 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 OR51B4-201ENST00000380224 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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CENPFP49454 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CENPFP49454 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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