Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LRRTM2O43300 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
LRRTM2O43300 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
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