Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CCDC96Q2M329 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms