Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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SYCP1Q15431 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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SYCP1Q15431 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SYCP1Q15431 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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