Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 AL161751.1-201ENST00000555636 1044 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PSMD6Q15008 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms