Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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RAB39AQ14964 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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RAB39AQ14964 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL845552.1-201ENST00000556820 323 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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RAB39AQ14964 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
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RAB39AQ14964 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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RAB39AQ14964 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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RAB39AQ14964 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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RAB39AQ14964 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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RAB39AQ14964 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RAB39AQ14964 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
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