Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
LMAN2Q12907 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
LMAN2Q12907 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms