Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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PGGT1BP53609 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PGGT1BP53609 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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